Ο Πανελλήνιος είναι από τους πρωτοπόρους συλλόγους της Ελλάδας στην ανάπτυξη του μπάσκετ. Η ομάδα ανδρών κατέκτησε 5 συνεχόμενα πρωταθλήματα κατά τη διάρκεια της δεκαετίας του 1950. Εκείνη η ομάδα ήταν τεχνικά πρωτοπόρα για την εποχή της. Για πολλά χρόνια, η ανδρική ομάδα συμμετείχε στα πρωταθλήματα Α1 και Α2, και το 2010 προκρίθηκε στο Final 4 του Eurocup basketball της Euroleague.
Σήμερα οι ομάδες μπάσκετ του Πανελληνίου συμμετέχουν στις εξής διοργανώσεις:
- Η ανδρική (ερασιτεχνική) ομάδα στο τοπικό πρωτάθλημα της ΕΣΚΑ (Β’ κατηγορία) και στο κύπελλο της ΕΣΚΑ
- Οι ομάδες εφήβων, παίδων και παμπαίδων στα αντίστοιχα πρωταθλήματα της ΕΣΚΑ
- Το τμήμα λειτουργεί ακαδημία μπάσκετ αγοριών
- Σε διάφορα τουρνουά στην Αττική για την κατηγορία ΜΙΝΙ
- Το τμήμα διοργανώνει τουρνουά Χριστουγέννων και Πάσχα
Αθλητές Ομάδας Ανδρών:
| ΟΝΟΜΑ ΑΘΛΗΤΗ | ΥΨΟΣ ΑΘΛΗΤΗ | ΗΛΙΚΙΑ ΑΘΛΗΤΗ |
| ΓΚΟΛΙΑΣ ΚΩΝΣΤΑΝΤΙΝΟΣ | 1.80 | 1996 |
| ΤΣΑΤΣΑΣ ΠΑΝΤΕΛΗΣ | 1.82 | 1997 |
| ΚΑΠΙΝΙΑΡΗΣ ΔΙΟΝΥΣΗΣ | 1.88 | 1991 |
| ΠΕΤΡΟΥΛΑΣ ΣΠΥΡΟΣ | 1.87 | 1994 |
| ΖΑΧΑΡΟΣ ΒΑΓΓΕΛΗΣ | 1.85 | 1989 |
| ΛΑΜΠΡΟΥ ΣΠΥΡΟΣ | 1.89 | 2001 |
| ΛΕΚΚΑΣ ΓΕΡΑΣΙΜΟΣ | 1.92 | 2000 |
| ΠΑΠΑΝΙΚΟΣ ΛΑΜΠΡΟΣ | 1.90 | 1995 |
| ΑΡΝΑΟΥΤΑΚΗΣ ΜΑΡΙΟΣ | 1.88 | 1988 |
| ΤΣΑΚΑΛΑΚΗΣ ΑΝΑΣΤΑΣΙΟΣ | 1.97 | 1999 |
| ΣΚΟΝΔΡΑΣ ΠΑΝΑΓΙΩΤΗΣ | 2.04 | 1992 |
| ΑΡΜΠΕΛΙΑΣ ΣΤΕΛΙΟΣ | 1.80 | 1999 |
| ΑΘΑΝΑΣΟΠΟΥΛΟΣ ΔΗΜΗΤΡΗΣ | 1.87 | 1993 |
| ΚΑΤΙΑΚΟΣ ΔΗΜΗΤΡΗΣ | 2.05 | 1987 |
| ΚΟΥΜΟΥΝΔΟΥΡΟΣ ΝΙΚΟΣ | 1.99 | 1999 |
| ΚΟΡΡΕΣ ΓΙΩΡΓΟΣ | 1.93 | 1987 |
